研究COVID-19的包膜蛋白

卡洛琳·e·昂克,KAUST Discovery

SARS和COVID-19病毒基因之间的相似性可以为潜在治疗方法的研究提供信息

了解SARS和COVID-19炎症之间的任何相似之处都可能在临床环境中有所帮助。导致COVID-19和SARS的病毒中的一种蛋白质几乎是相同的。研究人员提出,使用fda批准的针对COVID-19的药物(已经在感染了SARS的小鼠上进行了测试),是否可以改善出现严重呼吸道症状的COVID-19患者的预后。

这一发现是KAUST团队的合作成果Betacoronavirus基因组。“我们在KAUST有长期分析基因组数据的专业知识计算生物科学研究中心分子生物学家说,隆Gojobori

Gojobori,卡洛斯·m·杜阿尔特一组科学家比较了24个基因Betacoronaviruses包括导致COVID-19的四种SARS-CoV-2病毒。其中两个在美国测序,另外两个在中国测序。

“SARS-CoV-2似乎是最近从其他相关疾病进化而来的Betacoronaviruses,例如引起SARS和中东呼吸综合征(MERS)的病毒,”解释说Intikhab阿拉姆他是这项研究的第一作者。“我们想了解SARS-CoV-2的基因组成。了解发生了什么变化可能有助于找到检测病毒和了解其快速传播的方法。观察这些病毒中哪些保留了下来,可能有助于预测治疗方法是否会发展到其他病毒Betacoronaviruses可以对SARS-CoV-2起作用,”他说。


功能基因组分析表明,决定SARS致病力的蛋白E可作为COVID-19并发症的治疗靶点
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他们的基因组比较和结构分析发现,在SARS- cov -2和SARS病毒(称为SARS- cov -1)中,一种跨病毒膜的小蛋白质,称为包膜蛋白E,几乎是相同的。

SARS病毒中这种蛋白质的分子成分有助于触发宿主释放引起炎症的物质。这种炎症反应导致液体在肺部积聚,导致呼吸困难,这种情况称为急性呼吸窘迫综合征。研究SARS病毒的科学家发现,fda批准的药物可以抑制小鼠的这种反应。Alam说:“抑制以前SARS病毒的包膜蛋白E的药物也应该可以阻断COVID-19中的蛋白质。”“尽管这些药物不能阻止病毒的传播,但我们希望它们能够减轻或预防急性呼吸窘迫综合征,帮助拯救生命。”

该团队目前正在沙特阿拉伯寻找合作医院来进行这些药物的试验。他们还打算利用这些数据来帮助设计一种有效的疫苗。他们的数据是公开的BetacoronavirusPangenome数据库.与其他研究小组一样,他们正在与世界卫生组织公开分享与COVID-19有关的早期研究。

这幅艺术的SARS-CoV-2病毒图显示了膜蛋白(绿色)、包膜蛋白(紫色)和特征性刺突蛋白(橙色)。
©2020 KAUST;泽维尔皮塔饼