<粗体>目的:粗体>建立一种新的风险评分模型,预测结肠癌患者的生存和免疫反应。
<粗体>结果:粗体>从7846个差异表达基因(DEGs)中筛选出679个免疫相关基因。GO和KEGG分析发现,免疫相关的DEGs主要富集在免疫应答、补体激活、细胞因子-细胞因子受体相互作用等方面。最后,我们建立了3个免疫相关基因风险评分模型,该模型是结肠癌总生存期(OS)的准确独立预测指标。 Correlation analysis indicated that there were significant differences in T cell exclusion potential in low-risk and high-risk groups.
雌性生殖周期,在灵长类和非灵长类哺乳动物中分别称为月经周期或发情周期,在非怀孕状态下主导生殖过程。然而,除了生殖组织之外,生殖周期也可以进行全面调节,因为在整个周期中波动的两种主要女性激素雌激素和孕酮的受体分布广泛。因此,为了更好地理解生殖周期中的系统性变化,人们不断需要多组织基因表达图谱,但在很大程度上仍未确定。在这里,我们通过rna测序描绘了C57BL/6J雌性小鼠在发情周期的两个阶段(发情期和退情期)的15个组织的转录组景观。然后,揭示了一些参与发情周期的基因、途径和转录因子。我们发现发情周期对神经功能、免疫功能、凝血功能等有广泛的调节作用。在发情期和退情期的转录组变化背后,可能有13个转录因子起重要作用。接下来,使用1263个人工策划的各种生理和病理生理状态的基因签名进行生物信息学建模,系统地描述了发情/背情对个体组织带来的有益/有害影响。我们揭示了发情周期对心血管系统(主动脉、心脏、静脉)有显著的影响,其中发情诱导的主动脉降压模式是最显著的发现之一。受此启发,我们通过小鼠和大鼠实验验证了两种降压药物非洛地平和乙酰丁醇对发情的疗效明显优于对止泻的疗效。 Together, this study provides a valuable data resource for investigating reproductive cycle from a transcriptomic perspective, and presents models and clues for investigating precision medicine associated with reproductive cycle.
罗非鱼湖病毒(TiLV)是一种新兴的罗非鱼致命病毒,威胁着全球罗非鱼养殖,严重影响粮食安全。TiLV具有与正粘病毒相似的特征,但属于羊膜病毒科罗非鱼病毒的唯一和单型属。TiLV包膜病毒粒子包裹着由十个单链负RNA片段组成的基因组。值得注意的是,TiLV的10种主要蛋白质中有9种与任何已知的病毒或细胞蛋白质缺乏序列同源性。TiLV进入罗非鱼细胞的方式尚不清楚。在测量了TiLV的进入窗口(约3小时)后,我们应用了一组已知内吞功能调节因子的抑制剂来绘制TiLV进入的分子需求图。我们通过量化TiLV核蛋白表达和感染颗粒的产生来确定生产性进入。王朝矿或dynole抑制动力蛋白活性,或甲基-β-环糊精消耗胆固醇,强烈抑制TiLV蛋白合成和感染性病毒粒子的产生。此外,在进入窗口内抑制拉琴库素A引起的肌动蛋白细胞骨架聚合或诺可达唑引起的微管聚合可部分抑制TiLV感染。相比之下,内吞体酸化抑制剂(NH4Cl,巴非霉素A1,或氯喹),网格蛋白包被的坑组装抑制剂(pitstop 2)和厄洛替尼-内吞周期蛋白g相关激酶(GAK)抑制剂,不影响TiLV进入。 Altogether, these results suggest that TiLV enters
<粗体>背景:粗体>严重生精失败(SPGF)是男性不育最相关的原因之一。这种病理状况可导致精子数量的极端异常,如严重少精症(SO)或非阻塞性无精症(NOA)。大多数SPGF病例病因不明,但已知这种特发性男性不育症是一种复杂的疾病。在这项研究中,我们旨在评估<斜体>TEX15斜体>的常见遗传变异是否与特发性SPGF的易感性有关,该基因编码精子发生的关键角色。
<粗体>材料和方法:粗体>我们设计了一项遗传关联研究,包括来自伊比利亚半岛的共727例SPGF病例(包括527例NOA和200例SO)和1058例未受影响的男性。按照标记策略,选择三个<斜体>TEX15斜体> (rs1362912, rs323342和rs323346)的标记单核苷酸多态性(SNPs)使用TaqMan探针进行基因分型。然后用逻辑回归模型进行病例-对照关联检验。<斜体>在硅斜体>分析也进行了阐明假定的功能含义的研究变体。结果:与对照组(MAF = 0.0468, OR = 1.90, < >p > = 7.47E-03)或NOA组(MAF = 0.0472, OR = 1.83, < >p > = 1.23E-02)相比,SO患者组(MAF = 0.0842)的< >TEX15 >-rs1362912次要等位基因频率(MAF)显著增加。SO群体的基因型分布也与对照组(<斜体>p斜体> = 1.14E-02)和NOA组(<斜体>p斜体> = 4.33-02)不同。 The analysis of functional annotations of the human genome suggested that the effect of the SO-associated