雷竞技rebat病毒学前沿|最新文章 https://www.雷竞技rebatfrontier雷竞技电竞体育竞猜平台sin.org/journals/virology 病毒学前沿|最新文章的RS雷竞技rebatS提要 en - us 雷竞技rebat边疆馈电发生器,版本:1 2022 - 12 - 22 - t09:10:08.9770542 + 0 60 https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1044652https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1044652异质核核糖核蛋白在病毒生命周期中的不同作用 2022 - 12 - 22 - t00:00:00z 克里希纳巴特拉伊 马丁Holcik 了解宿主-病毒相互作用有助于破译病毒复制策略和发病机制。病毒的基因含量有限,并严重依赖宿主细胞来建立成功的感染。病毒在整个生命周期中依赖宿主获得广谱的细胞rna结合蛋白(RBPs)。一个主要的RBP家族是异质核核糖核蛋白(hnRNPs)家族。hnRNPs通常定位于细胞核,在那里它们与pre-mRNAs形成复合物,并有助于核酸代谢的许多方面。hnRNPs包含RNA结合基序,经常作为RNA伴侣参与pre-mRNA加工、RNA剪接和输出。许多hnRNPs穿梭于细胞核和细胞质之间,并影响细胞质过程,如mRNA的稳定性、定位和翻译。hnRNPs和病毒成分之间的相互作用是众所周知的。它们对于处理病毒核酸和蛋白质至关重要,因此影响病毒感染的成功。本文综述了hnRNPs与病毒生命周期各个阶段(如复制、剪接、翻译和病毒子代组装)相互作用和调节的分子机制。 In addition, we expand on the role of hnRNPs in the antiviral response and as potential targets for antiviral drug research and development.

https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1078454https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1078454细胞质核糖核蛋白复合物,RNA解旋酶和冠状病毒感染 2022 - 12 - 14 - t00:00:00z 李王 玛丽亚·古斯曼 伊莎贝尔苍井空 Luis Enjuanes 索尼娅·祖尼加 真核细胞中的RNA代谢包括核糖核蛋白复合物(RNPs)的形成,RNPs根据其蛋白质成分具有不同的功能。细胞质RNPs,如应激颗粒(SGs)或p -体(PBs),在感染过程中调节病毒和细胞RNA表达,并在宿主细胞抗病毒反应中发挥关键作用。RNA解旋酶是RNPs的重要组成部分,对病毒感染有重要影响。本文综述了RNPs和RNA解旋酶在冠状病毒感染过程中的作用。冠状病毒是一种新型高致病性病毒,具有较大的单链RNA基因组。在冠状病毒感染过程中,不同RNP结构中的rna -蛋白质相互作用形成了一个复杂的网络。一般来说,RNA解旋酶和RNPs具有抗病毒功能,但关于病毒蛋白与细胞成分的相互作用是这种抗病毒作用的介质还是冠状病毒抗病毒抵消机制的一部分,我们的知识有限。还需要更多的数据来阐明这些rna -蛋白质相互作用在冠状病毒感染过程中的作用,以及它们对病毒复制或发病机制的潜在贡献 https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1073619https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1073619宿主tRNA外延转录组:RNA病毒感染的新参与者 2022 - 12 - 06 - t00:00:00z Marc Tallo-Parra 埃琳娜Muscolino 胡安娜Diez 病毒完全依赖宿主转译机制来表达病毒蛋白。最近的数据揭示了正链RNA (+)RNA)病毒与宿主tRNA外转录组之间前所未有的相互作用,以促进病毒蛋白表达<斜体>通过<斜体>密码子优化的特定重编程,最终有利于病毒密码子的解码。我们认为多种RNA病毒都具有这一特征,所涉及的tRNA修饰酶为开发广谱抗病毒药物提供了有前途的新靶点 https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1028335https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1028335SARSNTdb数据库:影响SARS-CoV-2序列守恒的因素 2022 - 12 - 01 - t00:00:00z 约翰Orgera 詹姆斯·凯利 暗利酒吧 Sathyanarayanan•韦迪雅那桑 安德烈眼镜 SARSNTdb为具有不同程度SARS-CoV-2知识的用户提供了一个精心策划的、以核苷酸为中心的数据库。其用户友好的界面允许查询编码区域和坐标间隔,以找出作用于相应核苷酸和氨基酸的各种功能和选择性约束。用户可以很容易地获得有关病毒基因和蛋白质、功能域、重复序列、二级结构形成、基因组内相互作用和突变流行率的信息。目前,许多数据库都集中在系统发育和氨基酸取代上,主要集中在刺突蛋白上。我们采取了一种新颖的、更专注于核苷酸的方法,因为RNA不仅仅是编码蛋白质,而且可以从它的研究中收集到许多见解。例如,针对SARS-CoV-2的rna靶向药物治疗目前正在开发中,了解仅在该水平可见的特征至关重要。该数据库使用户能够识别更容易形成药物靶向的二级结构的区域。SARSNTdb还提供了来自约25,000例患者样本子集的说明性突变数据,具有可靠的全基因组(来自大流行的不同位置和时间点)读取覆盖。最后,该数据库允许比较SARS-CoV-2和SARS-CoV的结构域和序列。SARSNTdb可以服务于研究界,作为一个策划的信息库,它可以为分析突变的影响提供一个跳跃,远远超出确定蛋白质序列中的同义/非同义替换 https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1026452https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1026452概述HCMV如何操纵宿主细胞内运输网络可以促进生产性感染 2022 - 11 - 28 - t00:00:00z 贝利·s·莫舍 Timothy F. Kowalik 安德鲁·d·尤罗奇科

人类巨细胞病毒(HCMV)是免疫功能低下和发育中的胎儿发病和死亡的重要原因。感染也与慢性炎症疾病、心血管疾病和某些癌症的发展有关。与HCMV感染相关的广泛病理可归因于病毒的广泛细胞趋向性,感染影响每个器官系统。像其他病毒一样,HCMV必须调整宿主细胞以支持生产性感染。特别是HCMV投入了许多资源和各种策略来操纵宿主细胞内运输网络,以促进所有感染细胞类型的感染的各个方面。宿主细胞内运输网络的失调使病毒转运到宿主细胞核进行基因组复制,促进病毒蛋白和未成熟病毒粒子的核导入/输出,破坏宿主免疫反应,形成新的细胞器进行子代病毒粒子组装、成熟和排出,促进细胞迁移和病毒传播。然而,由于其复杂的性质,这些过程的许多方面都没有得到很好的研究。新的研究和基于组学的技术最近开始阐明HCMV失调宿主细胞运输机制的程度。在这里,我们综述了HCMV利用失调细胞内运输网络来促进生产性感染的各种策略 https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1050880https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1050880塞内加尔在常规发烧监测中发现属于sylvatic基因型的登革病毒2人间病例,科尔达2021年 2022 - 11 - 17 - t00:00:00z 伊迪昂 桑巴娘Sagne Mignane Ndiaye Mamadou Aliou Barry 逃往要 Moufid Mhamadi Diamilatou巴尔德 谢赫·塔利布亚·图雷 暴咪咪迪奥普 Amadou Alpha Sall Gamou下降 逃往Loucoubar Oumar法耶 达博法耶 登革热病毒2 (DENV-2)在塞内加尔南部科尔达地区Saré Yoba的一名发热患者身上检测到。基于完整编码区的系统发育分析显示,该病毒属于DENV-2森林型基因型,与2009年在西班牙一名前往几内亚比绍(与科尔达地区接壤)旅游的游客身上检测到的一株病毒(JF260983/99.66%鉴定)密切相关。这突出表明,塞内加尔南部地区最近森林登革热的传播可能漏报,并呼吁通过“同一个健康”的方法加强人类、非人类灵长类动物和树栖蚊子之间的综合监测 https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.968338https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.968338工程合成DNA疫苗诱导对尼帕病毒的免疫应答 2022 - 11 - 10 - t00:00:00z Hyeree崔 Sagar B. Kudchodkar 紫阳徐 米歇尔·何 彭小 斯蒂芬妮·拉莫斯 Laurent Humeau 大卫·b·韦纳 冰斗Muthumani 尼帕病毒(NiV)是一种重新出现的病原体,可在动物和人类中引起严重疾病。目前针对无肝病毒感染的治疗措施还不够,目前还没有批准的针对人或动物的无肝病毒疫苗。尼帕病毒被世界卫生组织(世卫组织)列为疫苗和治疗研究的高度优先病原体。在本研究中,我们利用合成增强DNA技术设计和生产新的一致NiV融合(NiV- f)和糖蛋白(NiV- g)抗原序列,以包含在合成的NiV DNA疫苗中。每种疫苗抗原的体外表达均经免疫结合试验证实<斜体> 。电穿孔增强肌内注射NiV-F和NiV-G小鼠诱导对NiV-G和NiV-F的多个表位产生强烈的细胞免疫应答,包括抗原特异性CD8+ T细胞。两种疫苗都能在小鼠中引起高抗体滴度,一次免疫足以使100%的免疫动物血清转化。此外,NiV-F疫苗还诱导抗体来中和NiV-F伪型病毒颗粒。这些数据支持进一步研究这些新型合成增强型NiV核酸抗原,作为对抗尼帕病毒的有效疫苗的潜在成分 https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1049134https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1049134流感血凝素茎抗体CR9114:通往普遍保护的狭窄进化路径的证据 2022 - 11 - 02 - t00:00:00z 安娜·l·伯肯霍斯特 雅格布Frallicciardi 克拉丽莎·m·科赫 安吉拉•菲利普斯 迈克尔·m·德赛 Kanin Wichapong 格里·a·f·尼古拉斯 Wouter Koudstaal Galit改变 傻瓜古德米斯特 人类单克隆抗体(hmab)可预防所有甲型和乙型流感病毒株,被认为是通往通用流感疫苗的道路。基于公开数据,我们分析了CR9114对泛流感保护的机制和结构基础,CR9114是一种血凝素(HA)干反应性抗体,可抵御来自A1、A2和b组的流感亚型。CR9114的普遍保护机制基础不仅限于<斜体>体外中和,因为CR9114还在体内保护<斜体> 免受逃脱其中和活性的菌株的影响:融合抑制、病毒出口抑制和fc介导的效应功能的激活是CR9114普遍保护的关键因素。CR9114(泛流感保护)和结构相似的VH1-69 hmAb CR6261 (A1流感保护)之间的比较分析确定了泛流感保护的结构基础。CR9114的异亚型结合是由于它能够将HA与多个结构域结合:三个HCDR环和FR3。与其他VH1-69 hmAbs相反,CR9114在其HCDR3上使用一个长而极性的酪氨酸(Y)残基侧链与H3, H5和B HA形成关键的H键。通过CR9114识别高度保守的表位导致流感毒株逃脱的高遗传屏障。种系祖先和CR9114之间的嵌套,层次结构的突变表明,它是B细胞群体中狭窄的进化途径的结果。这一罕见的进化途径表明存在免疫隐性表位,疫苗诱导多克隆cr9114样反应的机会有限 https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.971293https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.971293在分化的单核细胞系和原代单核细胞来源的巨噬细胞之间,对HIV-1长末端重复序列的Sp亚型招募的改变 2022 - 11 - 01 - t00:00:00z 约翰·j·麦卡利斯特 Satinder Dahiya 雷切尔·伯曼 Mackenzie柯林斯 Michael R. Nonnemacher 特里西亚·h·布尔多 布莱恩Wigdahl 人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)在单核-巨噬细胞谱系细胞中的转录是由HIV-1长末端重复序列(LTR)和多种宿主细胞和病毒蛋白之间的相互作用调节的。Sp转录因子家族(tf)与LTR的G/C盒阵列的结合决定了基础的以及激活的LTR定向的转录活性。针对HIV-1 LTR,研究了单核细胞分化对Sp因子结合和转激活的影响。特别研究了Sp1、全长Sp3和截断Sp3与高affinity HIV-1 Sp元件的结合,结果表明,在化学诱导的单核细胞分化后,在单核细胞(U-937, THP-1)和髓单核细胞(HL-60)细胞中,Sp1结合相对于全长Sp3结合和截断Sp3结合的数量增加。此外,来自pma诱导的细胞系的Sp结合比率比来自非诱导细胞系的Sp结合比率更接近于来自原代单核细胞来源的巨噬细胞(MDMs)。Sp结合表型的改变与HIV-1 G/C盒阵列介导的转录激活的改变有关。此外,对Sp1和Sp3的翻译后修饰的分析显示,丝氨酸和苏氨酸残基磷酸化缺失,并伴有化学诱导分化,表明Sp因子的活性在翻译后修饰(PTMs)水平上受到额外的调控 https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.914888https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.914888评论:MSH3同源性和潜在重组与SARS-CoV-2糠醛裂解位点有关 2022 - 10 - 11 - t00:00:00z Yseulys Dubuy 雨果Lachuer https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1047852https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.1047852勘误表:调查前三种SARS-CoV-2变种的进化起源 2022年10月- 07 - t00:00:00z 马汉Ghafari Qihan刘 Arushi Dhillon Katzourakis阿里斯 Daniel B. Weissman https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.994843https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.994843前融合特异性抗体衍生肽三价呈现在dna纳米支架上作为一种对抗RSV进入的创新策略 2022 - 10 - 06 - t00:00:00z 莱拉Issmail 克里斯汀莫泽 基督教贼鸥 Basma Altattan 丹尼尔Ramsbeck 马丁Kleinschmidt 米尔科瓦斯 大卫·史密斯 托马斯•格伦沃尔德 人类呼吸道合胞病毒(RSV)是世界范围内儿童和老年人急性下呼吸道感染的主要原因,针对这种疾病既没有疫苗也没有有效的治疗方法被批准。RSV进入宿主细胞是由表面RSV融合(RSV- f)糖蛋白的逐步结构变化介导的。近年来RSV-F糖蛋白的结构和功能研究发现,其构象依赖性中和表位已成为疫苗和治疗开发的有吸引力的靶点。由于RSV-F以三聚体形式存在于病毒表面,因此候选融合抑制剂与三种单体上各自表位之间的三价结合相互作用有望以比单价或二价抑制剂更高的效力预防病毒感染。在这里,我们展示了一种新的RSV进入抑制方法,通过实现三聚体DNA纳米结构作为模板,显示多达三个线性肽部分,同时靶向预融合RSV- f蛋白表面的一个表位。为了设计可以偶联到DNA纳米结构的合成结合肽,选择了预融合rsv - f特异性单克隆抗体(D25)。互补决定区3 (CDR3)衍生肽进行截断和丙氨酸扫描诱变分析,然后使用非典型氨基酸进行系统序列修饰。最有效的候选肽被用作结合部分来功能化DNA纳米结构。设计的DNA肽结构能够比单体肽更有效地阻断细胞上的RSV感染,然而,经鼻内应用后,在感染小鼠的肺部观察到更温和的病毒载量降低,这可能是由于肺中细胞对底层DNA结构的解离或吸收。综上所述,我们的结果指向了一种新的基于三聚体dna肽的方法对RSV的抑制潜力,并开辟了将该平台应用于靶向其他病毒感染的可能性 https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.999929https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.999929血浆干扰素-γ浓度:系统性慢性活动性eb病毒感染疾病活动性的潜在生物标志物 2022 - 09 - 29 - t00:00:00z Yu Uemura 绚香大桥 迈乌米Yoshimori Miwako西 Tsuneaki Hirakawa说道 Norio清水 拿俄米和田 中国云南Imadome 若Arai 全身性慢性活动性eb病毒感染(sCAEBV)是一种难治性疾病,表现为活化的ebv感染的T-或nk细胞及其克隆性增殖。当炎症症状持续并继续时,会出现吞噬性淋巴组织细胞增多症(HLH)的致命并发症,但迄今为止尚未开发出代表其病理生理的生物标志物和有效的治疗药物。已知HLH外周血中干扰素-γ (IFN-γ)水平升高与病情相关,拮抗IFN-γ抗体对HLH有效。我们检测了血浆IFN-γ水平,以研究其在sCAEBV疾病状况中的作用。sCAEBV的诊断标准符合2017年发布的WHO分类中sCAEBV的定义。正如先前报道的那样,疾病活动性被定义为以下任何一种症状呈阳性:发热、肝功能障碍、进行性皮损、血管炎和葡萄膜炎。对18例sCAEBV患者进行了检查。他们的血浆IFN-γ水平明显高于健康捐赠者。有疾病活动性的sCAEBV患者血清血清素水平高于无疾病活动性的患者。所有患者ebv感染细胞中均检测到<斜体>IFNG mRNA的表达。 We also detected a correlation between plasma IFN-γ levels and mRNA levels of EBV-infected cells in peripheral blood mononuclear cells. These results suggest that EBV-infected cells produce IFN-γ in sCAEBV. Although the difference was not significant, the patients whose plasma IFN-γ levels at diagnosis were higher than 40 pg/mL tended to result in poorer survival than those with lower levels. We concluded that plasma IFN-γ is a potential biomarker that indicates disease activity of sCAEBV. Further study shall confirm its significance.

https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.972452https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.972452SARS-CoV-2垂直传播支持先天胎儿保护:叙述性回顾 2022 - 09 - 23 - t00:00:00z Eytan R. Barnea Nicoletta Di Simone Soren Hayrabedyan Krassimira Todorova 安娜莉莎Inversetti 乔凡尼Vento Simonetta科斯塔 经过全面研究的产前感染有助于构建当前与严重急性呼吸综合征相关的冠状病毒-2 (SARS-CoV-2)大流行的框架,但需要注意的是,无症状的SARS-CoV-2感染患者不进行检测,而有症状的患者则就地提供和/或药物治疗。因此,管理和治疗仍然是不同的。SARS-CoV-2诱导的呼吸道感染主要是局部的,除非严重,否则会减少经胎盘垂直传播(VT)。怀孕前或怀孕期间接种疫苗可显著改变母亲和新生儿的预后。传播到胎儿的病毒可以结合ACE2和TMPRSS2蛋白受体。最近的一项研究表明,从妊娠中期开始,ACE2和TMPRSS2在胎儿肠道中表达。大多数胎盘感染是亚临床的,除非观察到严重的绒毛炎和细胞凋亡。胎盘很少被检测,而且很有可能大多数胎盘对病毒呈阳性,需要复杂的诊断来记录。其他VT方式,如阴道、直肠或羊水污染,是非常罕见的。因此,在临床上可行时,阴道分娩更可取。 It has not yet been determined whether the placenta is a shield or if it transmits infection, while, on the other hand, recent data support fetal resilience, which is plausible due to the major difference between the placental and fetal rates of infection: only 3%–5% of documentable VT compared with up to 100% expected placental exposure to viremia. Newborn Polymerase Chain Reaction (PCR) from nasal swab is more practical as an option for VT diagnosis compared to ocular or anal swab, with low yield. The maternal infection leads to antiviral IgG production of 100% in severe cases, which is transferred to the fetus and breast milk. Postpartum-documenting VT is difficult since horizontal viral transmission may be common and minimized by mother/staff/family-preventive measures. Breastfeeding is safe and encouraged because, beyond nutrition, it promotes protective antibody transfer and maternal bonding. Lessons learned from other Betacorona viruses (SARS-CoV and Middle East Respiratory Syndrome related coronavirus [MERS-CoV]) virulence are relevant since mutations can increase or decrease vulnerability. Overall, data support fetal/newborn resilience against SARS-CoV-2 VT. However, viremia monitoring by sensitive tests and assessment for delayed sequelae shown in adults is necessary.

https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.953208https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.953208孕酮对甲型H1N1流感病毒2009感染肺和胎盘细胞后先天免疫和细胞死亡的影响 2022 - 09 - 23 - t00:00:00z 米兰达李 阿曼达·李 淡褐色黄 杰夫·芒森 Adebimpe Obadan 黛博拉·h·富勒 克里斯蒂娜·m·亚当斯·霍道夫

2009年甲型流感病毒(IAV) H1N1大流行与孕产妇死亡、早产和死产风险增加有关。严重母亲肺部疾病和死产的潜在机制尚不完全清楚,但已知IAV感染可激活先天免疫,触发细胞因子的释放。阐明孕酮(P4)在妊娠期升高的关键激素对IAV感染的先天免疫和炎症反应的影响是了解不良母胎结局发病机制的关键一步。用IAV H1N1 pdm/09在感染多重率(MOI)为0、0.5和3时感染带有或不带有P4 (100 nM)的Calu-3(肺腺瘤)和ACH-3P(滋养层外细胞)细胞株。在感染后24和48小时(hpi)收集细胞,并分析细胞病变效应(CPE)、复制病毒(TCID50)、细胞毒性(乳酸脱氢酶(LDH)测定)和NLRP3炎性小体活化(caspase-1活性,荧光测定)。通过测量先天免疫激活(<斜体>IFIT1, IFNB)、炎症(<斜体>IL6)、干扰素信号(<斜体>MXA)、趋化因子(IL-8, IL-10)的生物标志物基因和蛋白质表达,定量了抗病毒先天免疫激活(RT-qPCR, Luminex)。CPE和复制病毒的恢复表明,Calu-3和ACH-3P在每个时间点都对IAV感染高度允许。在Calu-3中,孕酮治疗与细胞毒性显著增加、<斜体> < IL6基因表达增加以及IFN-β、IL-6和IL-18蛋白表达增加相关。相反,在ACH-3P中,孕酮处理与细胞毒性显著抑制、<斜体>IFNB基因表达降低、<斜体>和<斜体>IL1B基因表达降低以及IFN-β和IL-6蛋白表达增加相关。在两个细胞系中,孕激素处理后caspase-1活性显著降低,这表明NLRP3炎症小体激活并不是Calu-3细胞死亡升高的基础。 In summary, these data provide evidence that progesterone plays a dual role by ameliorating viral infection in the placenta but exacerbating influenza A virus-associated injury in the lung through nongenomic modulation of the innate immune response.

https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.972156https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.972156预测内源性逆转录病毒- k蛋白酶的细胞相互作用 2022 - 09 - 23 - t00:00:00z 撒母耳Narvey 亚历克斯Vandenakker 梅根Rempel Renée N.杜维尔 逆转录病毒蛋白酶是病毒复制的基本酶,并驱动细胞蛋白质组内的变化。虽然一些研究已经证明,外源性逆转录病毒的蛋白酶(PR)酶可以切割细胞蛋白质并调节细胞信号,但内源性逆转录病毒编码的PR在人类基因组中的影响在很大程度上被忽视了。一种被称为内源性逆转录病毒- k (ERVK)的人类共生体在病理上与神经系统疾病和癌症相关。使用计算生物学方法,我们试图表征ERVK PR相互作用组。利用真核线性Motif (Eukaryotic Linear Motif, ELM)数据库对ERVK PR蛋白序列进行分析,并将结果与其他逆转录病毒PR和类似内源性病毒PR的ELMs进行比较。一个假定的ERVK PR细胞蛋白相互作用体列表是从ELM列表中筛选出来的,并提交给STRING分析以生成ERVK PR相互作用组。使用反应组分析来识别可能受ERVK PR影响的关键通路。网络分析假设ERVK PR在几种泛素化通路的顶端相互作用,并在DNA损伤反应、基因调控和细胞内运输中发挥作用。在逆转录病毒PR中,与增殖细胞核抗原(PCNA)的相互作用是ERVK PR所特有的。最显著的疾病相关途径是病毒致癌和神经退行性变。这加强了ERVK PR在这些病理中的作用,通过推测驱动细胞信号级联<斜体>通过<斜体>选择蛋白质-蛋白质相互作用

https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.973997https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.973997起始信号:异常激酶激活可触发SARS-CoV-2诱导的轴突损伤 2022 - 09 - 23 - t00:00:00z Alexsia理查兹 鲁道夫Jaenisch https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.994057https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.994057影响植物病毒进化的因素概述 2022 - 09 - 20 - t00:00:00z Anamarija Butković 鲁本冈萨雷斯 病毒是高度进化的生物实体,能够对我们的社会造成严重破坏。因此,更好地了解病毒进化是重要的,主要有两个原因:(i)它将导致更好地管理当前疾病和预防未来疾病,以及(ii)它将有助于更好地理解进化过程及其动态。为了从整体上理解病毒的进化,有必要考虑影响病毒进化的不同因素。在这篇综述中,我们概述了决定植物病毒进化的最相关因素。我们将重点研究突变率、上位性、稳健性、重组、基因组组织、病毒-宿主相互作用、传播、群落相互作用和非生物因素。由于这篇综述概述了病毒进化中最重要的因素,它可以为任何对接近(植物)病毒进化感兴趣的人提供有用的起始材料 https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.994842https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.994842紫外线诱导的HIV-1传染性完全丧失的主要靶点:单链RNA包膜病毒的模型研究 2022 - 09 - 20 - t00:00:00z 黄家驹高明 Doi直 Akihiro铃木 Nagamatsu太郎 Yasui武 Koji Yasutomo 丰田足立 Takeo Minamikawa 雅子Nomaguchi 深紫外光(UV)对微生物,包括细菌和病毒的消毒是有用的。虽然紫外线对基因组的损伤已被广泛接受,但紫外线对病毒蛋白(包括包膜成分)活性和/或功能的不利影响鲜有文献记载。值得注意的是,观察到的对病毒不利的紫外线影响仅与病毒传染性降低有关,并没有进行充分的分析。在本研究中,我们利用HIV-1作为单链RNA包膜病毒的模型,旨在阐明受紫外线影响的病毒粒子的哪个成分与病毒传染性的丧失显著相关。使用我们的紫外照射装置在三个波长(265、280和300 nm),我们首先定量确定了降低传染性所需的每个波长的紫外功率密度和照射周期。作为对照的热处理样品显著降低了病毒粒子相关逆转录酶(RT)活性和Gag-p24水平。在完全缺乏病毒传染性的三个波长的紫外线照射样品中,显示出与未照射的样品相似的p24水平。虽然病毒粒子相关的RT活性以波长和功率密度依赖的方式逐渐降低,但这种降低并不能解释紫外线对病毒传染性的影响。值得注意的是,病毒学分析显示,在三种波长下,紫外线照射病毒样本的进入效率与未照射的病毒样本相当。重要的是,这一结果表明,即使在不同波长的紫外线照射下,病毒粒子仍然保持其由宿主脂质双分子层和病毒蛋白组成的包膜的功能。 In sharp contrast, UV-induced genome damage shown by semiquantitative RT-PCR correlated well with the reduction in viral infectivity, indicating that it is a major determinant for virus inactivation by UV. The degree of damage was found to be distinct among the regions analyzed. This was probably due to the different nucleotide sequences in those genomic regions amplified by PCR. Our data clearly demonstrate a principal mechanism for viral inactivation by UV and provide information contributing to the improvement of UV-based disinfection technology for microorganisms.

https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.934011https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2022.934011分类基序将瓜病毒的运动蛋白定位于反式高尔基网络和胞间连丝 2022 - 09 - 16 - t00:00:00z 娜塔莉Ozber 保罗Margaria 查尔斯·安德森 马西莫Turina 克里斯蒂娜·罗莎 植物有一个高度复杂的内膜系统,被植物病毒靶向进行细胞间移动。乌蜜瓜病毒(OuMV)的运动蛋白(MP)被传递到胞间连丝(PD)并形成小管以促进细胞间运动。在我们之前的工作中,我们确定了OuMV的位置以进行正确的亚细胞定位;然而,OuMV MP pd靶向所涉及的途径在很大程度上尚不清楚,而这些途径的识别是这项工作的目的。在本研究中,我们证明OuMV MP定位于跨高尔基网络(TGN),但不定位于多泡体/前泡室或高尔基,并在其n端附近携带两个假定的分类基序,一个酪氨酸(Y)和一个二亮氨酸(LL)基序。这些基序的替换导致<斜体> benthamiana和拟南芥OuMV传染性的丧失。gfp标记的排序基序突变体的活细胞成像显示,这两种基序都是将OuMV MP靶向PD和高效全身感染所必需的,但在功能上存在差异。此外,免疫共沉淀分析结合质谱分析确定了一系列宿主因子,这些因子可以与OuMV MP相互作用,并将MP与各种途径联系起来,特别是囊泡运输和膜脂质。我们的研究结果描述了OuMV MP用于pd靶向的运输路线,并阐明了OuMV MP可能招募的宿主因子,这些因子可以被修改以损害OuMV感染